探究小RNA-221 / 222 海绵体载体

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  微小RNA(microRNA,miR)-221 和222 是成簇分布的,其基因序列定位于Xp11.3 区,两者相邻呈前后排列。许多研究发现,miR-221 / 222 在肿瘤的发生、发展中起致癌基因或抑癌基因的作用[1]。miR-221 / 222 在包括口腔鳞状细胞癌(oral squamous cellcarcinoma ,OSCC)在内的多种肿瘤中存在表达异常,有望成为相关肿瘤的诊断、预后和治疗的新靶点[2-10]。

  Zhang 等[11]研究发现,miR-221 / 222 可直接结合第10 号染色体缺失的磷酸酶及张力蛋白同源物基因(phosphatase and tension homolog deleted onchromosome 10,PTEN)3′UTR,其可通过调控PTEN表达而作用于胃癌细胞生长、侵袭和放射敏感性等。miRNA 海绵体是高效的miRNA 抑制剂,其主要机制是通过建立多拷贝特异反义序列,吸附相应miRNA 从而抑制其表达[12]。本研究拟构建miR-221 /222 海绵体载体,同时抑制miR-221 和miR-222 的表达,初步探讨其在OSCC 细胞中的作用。

  材料与方法

  一、主要试剂与仪器

  pDC316-mCMV-EGFP 质粒载体(广州莱德尔),OSCC 细胞系UM1 细胞和感受态细胞DH5α 由本实验室保存,DNA 凝胶回收试剂盒(Dongsheng Biotech,中国),T4 DNA Ligase 酶(TaKaRa,日本),miRNeasyMini Kit 试剂盒(Qiagen,德国),Lipofectamine 2000转染试剂(Invitrogen , 美国),SYBR Green qPCRSuperMix(Invitrogen,美国),BCA 蛋白浓度测定试剂盒(碧云天生物技术研究所,中国),DMEM/ F12 培养基、Opti-MEM 培养基及胎牛血清(fetal bovine serum,FBS;GIBCO,美国);普通PCR 仪(Eppendorf,德国),SDS-PAGE 蛋白电泳仪、SDS-PAGE 蛋白转膜仪(Bio-Rad,美国),Alpha 凝胶成像系统(ZEISS,德国),RealtimePCR 仪(Roche,德国),光学显微镜(OLYMPUS,日本),荧光倒置显微镜(ZEISS,德国)。

  二、miR-221 / 222 海绵体序列设计及合成

  根据miRBase 数据库中has-miR-221 的成熟序列(3′-AGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUC-5′ , 序列号MI0000298)和has-miR-222 的成熟序列(3′-AGCUACAUCUGGCUACUGGGU-5′,序列号MI0000299),设计与has-miR-221 和has-miR-222 成熟序列完全互补的反义序列。将3 个has-miR-221 反义序列和3 个has-miR-222 反义序列以串联的方式连接,每个反义序列间插入-atgcatcg-碱基间隔连接,同时引入酶切位点NotⅠ和HindⅡ,最终合成miR-221 / 222海绵体序列(图1)。将海绵体序列原液稀释20 倍后用于扩增,引物正义链:5′-ataagaatgcggccgcAGATCTGCTAGCCCATATAAGGC-3′,引物反义链:5′-cccaagcttAGCTACATCTGGCTACTGGGTCG-3′。PCR 总反应体系为25 μl,包括0.5 μl 稀释后模板,0.3 μl引物正反义链,2 mmol / L dNTP 混合物2.5 μl,10 ×扩增缓冲液2.5 μl,25 mmol / L MgSO4 1.5 μl,KODPlus Neo 0.3 μl,ddH2O 17.1 μl。循环参数:94℃ 3 min;98℃ 15 s,58℃ 15 s,68℃ 20 s,30 个循环;68℃ 5 min;16℃保存。PCR 产物用DNA 凝胶回收试剂盒回收,得到251 bp 目的基因用于连接反应。

  三、miR-221 / 222 海绵体载体构建

  pDC316-mCMV-EGFP 载体经NotⅠ和HindⅡ双酶切后与合成的miR-221 / 222 海绵体序列用T4连接酶于16℃连接2 h,连接产物转入DH5α 感受态细胞后于含氨苄青霉素(Amp,100 μg / ml)的LB平板上铺板筛选,筛选结果送金唯智基因公司测序,序列经鉴定正确后进行后续实验。

  四、细胞培养和细胞转染

  UM1 细胞养于含有10% FBS 和1%双抗的DMEM/ F12 培养基中常规培养。转染前1 天对UM1细胞进行传代,使其汇合度为40% ~ 60%,转染采用Lipofectamine 2000 转染试剂。实验分为UM1 细胞组、pDC316 质粒组和miR-221 / 222 海绵体载体组。使用24 孔板,每孔加入500 μl 混合液,UM1 细胞组加入100 μl Opti-MEM 培养基作为A 液,质粒组和海绵体组分别将1 μg pDC316-mCMV-EGFP 质粒和1 μg miR-221 / 222 海绵体载体稀释到100 μlOpti-MEM 培养基中作为A 液;取1 μl Lipofectamine2000 溶解于400 μl Opti-MEM 培养基,作为B 液。B 液混合5 min 后,A 液和B 液混合,静止20 min后加到细胞培养板中,将细胞放回培养箱中常规培养,4 h 后换液。

  五、实时荧光定量聚合酶链反应

  转染后24 h 严格按照miRNeasy Mini Kit 试剂盒说明书提取UM1 细胞组、pDC316 质粒组和miR-221 / 222 海绵体载体组细胞miRNA。采用茎环法对提取的miRNA 进行逆转录。以U6 作为内参片段,目的片段has-miR-221 和has-miR-222,上游引物分别为:hsa-miR-221 为5′-ACACTCCAGCTGGGAGCTACATTGTCTGCTGG-3′ ,hsa-miR-222 为5′ -ACACTCCAGCTGGGAGCTACATCTGGCTACTG-3′,下游通用引物hsa-miR-221 / 222 为5′-CTCAACTGGTGTCGTGGA-3′。反应体系共20 μl 包括:稀释20 倍的cDNA模板5 μl,上游引物0.5 μl,下游引物0.5 μl,2× SYBRGreen qPCR SuperMix 10 μl,dH2O 4 μl。循环参数:50℃ 2 min;95℃ 2 min;95℃ 15 s,60℃ 32 s 读板,40 个循环。反应结束后,进行融解曲线分析,温度为65 ~ 95℃。每个样本重复3 次。采用2-DDCt 分析方法计算miR-221 / 222 的相对表达量。

  六、Western blot 检测

  细胞转染后48 h 提取各组细胞总蛋白,BCA试剂盒测定蛋白浓度,10% SDS-PAGE 后转移到PVDF 膜,5%脱脂奶粉封闭1 h 后加一抗, 4℃孵育过夜,TBST 洗膜后相应二抗孵育1 h,洗膜,ECL 试剂盒显影,拍照。

  七、Transwell 细胞侵袭实验

  4℃溶解Matrigel 胶过夜,无血清培养基以1 ∶ 4的体积比稀释,取50 μl 加入预冷的Transwell 小室中,37℃孵育2 h 使Matrigel 凝固。细胞转染第2 天,计数8 × 104 个细胞,用100 μl 无血清培养基重悬,加入Transwell 小室上室,在下室加入600 μl 完全培养基。37℃,5% CO2孵育24 h 后,取出小室,用棉签擦去上室的Matrigel 和细胞,4%多聚甲醛溶液固定20 min,磷酸盐缓冲液(PBS)洗涤,结晶紫染色10 min,PBS 洗涤后显微镜下观察拍照。

  八、统计学处理方法

  应用SPSS 13.0 软件对数据进行处理和统计分析,UM1 细胞组、pDC316 质粒组和miR-221 / 222海绵体载体组3 组细胞中miR-221 和miR-222 相对表达量,3 组间两两采用两独立样本t 检验,P <0.05 认为差异具有统计学意义。

  结果

  一、miR-221 / 222 海绵体载体的构建及验证

  miR-221 / 222 海绵体序列与经NotⅠ和HindⅡ双酶切后的pDC316-mCMV-EGFP 载体连接,连接产物转入DH5α 感受态细胞后铺板筛选,阳性克隆结果经测序,反馈序列与设计序列完全一致,见图2。

  二、细胞转染效率

  通过脂质体转染试剂Lipofectamine 2000 将带荧光标记的miR-221 / 222 海绵体载体转入UM1 细胞,24 h 后于荧光倒置显微镜下观察带荧光细胞占总细胞的比例,检测转染效率。UM1 各组细胞转染效率均在70%以上,细胞状态良好,满足后续实验要求,见图3。

  三、转染后miR-221 / 222 的表达

  实时荧光定量PCR 结果表明,UM1 细胞组、pDC316 质粒组和miR-221 / 222 海绵体载体组中miR-221 相对表达量分别为(0.90 ± 0.15)、(1.00 ±0.08)和(0.17 ± 0.02),见图4A;miR-222 的相对表达量分别为(0.93 ± 0.04)、(1.00 ± 0.08)和(0.14 ±0.01),见图4B。3 组中miR-221 的表达:miR-221/222 海绵体载体组与pDC316 质粒组和UM1 细胞组比较,差异均有统计学意义(t1 = 111.69,P1 = 0.001;t2 = 6.98,P2 = 0.002);3 组中miR-222 的表达:miR-221/222 海绵体载体组与pDC316 质粒组和UM1细胞组比较,差异均有统计学意义(t3 = 236.55,P3 =0.001;t4 = 22.06,P4 = 0.001);UM1 细胞组与pDC316质粒组比较,miR-221 和miR-222 表达差异无统计学意义(t5 = -0.86,P5 = 0.44;t6 = -4.86,P6 = 0.08)。

  四、Western blot 检测转染后蛋白表达

  Western blot 结果显示,miR-221 / 222 海绵体载体组与pDC316 质粒组和UM1 细胞组比较,PTEN蛋白水平表达显著增强;UM1 细胞组和pDC316 质粒组p-Akt 表达差异不明显,海绵体载体组p-Akt 表达明显减少;3 组细胞总Akt 表达水平差异不明显,见图5。

  五、Transwell 细胞侵袭实验检测细胞侵袭能力

  Transwell 实验结果显示,miR-221 / 222 海绵体载体组细胞侵袭能力较对照组降低,pDC316 质粒组和UM1 细胞组无明显差异,见图6。

  讨论

  目前,人类基因组确定的成熟miRNA 已超过2500 种,预计调节60%以上人类编码蛋白基因,其中超过50%的miRNA 定位于肿瘤相关区域[13-15]。OSCC 是最常见的头颈部恶性肿瘤,约占口腔肿瘤中的95%,虽然手术结合放化疗的综合治疗方法不断改进,但患者预后仍较差,5 年生存率仅在50%左右[16-18]。随着miRNA 在发育、生理和病理过程中的调节作用的发现与证明,miRNA 相关的基因治疗成为OSCC 治疗研究的热点。Gombos 等[19]研究发现,miR-21、miR-155 和miR-221 在OSCC 中表达异常,与OSCC 的发生密切相关。Yang 等[20]研究发现,增加OSCC 细胞中miR-221 / 222 的表达可以促进癌细胞的生长。江方方等[9-10]研究结果显示,反义miR-222 可靶向上调PUMA 基因表达促进OSCC凋亡。许多研究认为,miR-221 / 222 与OSCC 的发生、发展关系密切,有望成为OSCC 基因治疗的新靶点,但其具体作用机制尚未明确。

  研究miRNA 作用机制的最好实验方法是使目标靶基因失功能,目前对miRNA 失功能研究中常用的方法有三种:基因敲除技术、反义寡核苷酸抑制技术[21]和海绵体技术[12,22]。基因敲除技术可用于miRNA 的失功能研究,但miRNA 常具有多个编码基因,需要花费大量时间和费用建立基因敲除模型,且有一定技术难度。反义寡核苷酸抑制技术一般用于单个特定的miRNA,且抑制时间较短(24 ~72 h),在对miRNA 功能长期研究中存在明显局限性[23-24]。海绵体技术是Ebert 等[12]在2007 年最先提出并验证的, 设计包含多个目标miRNA 结合位点的海绵体序列,通过与目标miRNA 的特异性结合达到稳定的抑制作用。海绵体序列可以通过质粒、慢病毒、腺病毒等载体转染入细胞,转染时根据细胞表型和实验需要可以选择不同的载体、启动子和报告基因等,利于细胞的筛选观察。同时,海绵体的持续表达可长时间抑制miRNA 的活动,在细胞培养和体内实验中达到长期稳定的沉默靶miRNA的作用,从而更好的研究miRNA 的功能。此外,对于具有相同种子序列的同家族miRNA,海绵体可以同时抑制其活动,从而研究整个家族miRNA 的功能[12,22]。在miRNA 功能研究中,海绵体技术还可以通过串联不同miRNA 抑制序列,同时沉默不同miRNA,从而研究其共同作用,使实验更加灵活简便。本实验中通过串联miR-221 和miR-222 反义序列构建可同时沉默miR-221 和miR-222 的海绵体载体, 转染至OSCC 细胞UM1 中, 实时荧光定量PCR 结果显示miR-221 / 222 海绵体载体可以同时有效抑制miR-221 和miR-222 表达,从而证明海绵体载体构建成功。

  PTEN 是1997 年发现的第一个具有双磷酸酶活性抑癌基因,其通过磷酸酶作用,降低信号通路关键酶磷酸化水平,从而阻断通路信号,抑制细胞生长、血管生成、侵袭和迁移,诱导细胞的凋亡[25-27]。PI3K / Akt 是细胞内重要的信号通路,Akt 可通过磷酸化下游因子调节细胞功能,过度活化的Akt 可增强细胞侵袭、增殖和抗凋亡能力[28]。PTEN 通过使3,4,5-三磷酸磷脂酰肌醇(PIP3)去磷酸化为4,5-二磷酸酯酰肌醇(PIP2),阻断依赖于PIP3 作用的Akt 的活化,从而抑制肿瘤的发生和发展。生物信息学和荧光素酶报告分析表明miR-221 / 222 可直接结合PTEN3’UTR 调节PTEN 表达[11]。本研究通过转染miR-221 / 222 海绵体载体,抑制细胞内miR-221 / 222 表达,Western blot 结果表明,转染miR-221 /222 海绵体载体的UM1 细胞PTEN 表达上调, 而pAkt 蛋白表达水平下调。细胞侵袭实验中海绵体转染组细胞侵袭能力减弱,表明miR-221 / 222 海绵体载体可能通过上调PTEN 表达,抑制PI3K / Akt 信号通路,达到抑癌作用。本研究成功构建miR-221 /222 海绵体载体,并初步验证其对OSCC 细胞侵袭性的抑制作用,为进一步深入研究奠定基础。